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bilibili目前有开设有番剧、电影、国创、电视剧、综艺、纪录片、动画、游戏、鬼畜、音乐、舞蹈、影视、娱乐、知识、科技、资讯、美食、生活、汽车、时尚、运动、动物圈、VLOG、搞笑、单机游戏、虚拟UP主和公开课等27大板块。[g][89]
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番剧
连载动画、完结动画、资讯、官方延伸、新番时间表、番剧索引
国创[h]
国产动画、国产原创相关、布袋戏、动态漫·广播剧、资讯、新番时间表、国产动画索引
动画
MAD·AMV、MMD·3D、同人·手书、配音、模玩·周边、特摄、动漫杂谈、综合
鬼畜
鬼畜调教、音MAD、人力VOCALOID、鬼畜剧场、教程演示
舞蹈[90]
宅舞、街舞、明星舞蹈、国风舞蹈、颜值·网红舞、舞蹈综合[91]、舞蹈教程
娱乐
娱乐杂谈、CP安利、颜值安利、娱乐粉丝创作、娱乐资讯、明星综合、综艺
科技
数码、软件应用、计算机技术、科工机械、极客DIY
美食[i]
美食制作、美食侦探、美食测评、田园美食、美食记录
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单机游戏、电子竞技、手机游戏、网络游戏、桌游棋牌、GMV、音游、Mugen、游戏赛事
音乐
原创音乐、音乐现场、翻唱、演奏、乐评盘点、VOCALOID·UTAU、MV、音乐粉丝饭拍、AI音乐、电台、音乐教学、音乐综合、说唱
影视
影视杂谈、影视剪辑、影视整活、AI影像、预告·资讯、小剧场、短片、影视综合
知识
科学科普、社科·法律·心理、人文历史、财经商业、校园学习、职业职场、设计·创意、野生技能协会
资讯
热点、环球、社会、综合
生活
搞笑、亲子、出行、三农、家居房产、手工、绘画、日常
时尚
美妆护肤、仿妆cos、穿搭、时尚潮流
动物圈
喵星人、汪星人、小宠异宠、野生动物、动物二创、动物综合
虚拟up主
游戏、音乐、动画、其他
番剧区[j]、国创区和放映厅设有有索引方便查找。番剧区和国创区另有新番时间表。
除此之外，还设有专栏、直播与芒果TV合作专区，以及戏称的广告区和评论区。
各个分区有各自的热门视频板块。站内设有全站排行榜的同时也有原创榜、新番榜、影视榜、新人榜。
账号
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哔哩哔哩早期限制注册，只有特定时期才开放注册，后可以在任何时间注册，但没有邀请码激活或未通过考试的用户则无法成为正式用户，无法发弹幕，而早期已经注册的用户默认为正式用户。普通游客可以观看大部分视频，但是一部分视频没有权限观看，并且普通游客的弹幕系统相比于会员也受到限制，未升级至正式会员的用户无法发送弹幕。普通游客无法给视频及文章和Flash游戏留言，无法发送和下载弹幕，也不能查看历史弹幕、发布作品。未升级为正式会员的用户通过考试之后可以成为正式会员，正式会员可以发布弹幕[92][需要非第一手來源]。2015年5月19日前想要成为正式会员需回答一份100题的多项选择题，以ACG知识为主，混有历史，遗传学，电脑，化学知识等等，其难度之高被网友封为“中国御宅学高考”[93]。弹幕君权限及以上权限可以使用特殊弹幕模式[94]。2015年降低答题难度，要做20道礼仪题（要全部答对）和30道知识题（可自选题目类型，需要得到及格分数）就能成为正式会员。2017年2月26日恢复100题转正考试。[95]
会员制度
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哔哩哔哩弹幕网的会员等级制度灵感来源于魔法禁书目录[k][來源請求]，共分为七级[96][需要非第一手來源]，分别为LV0-LV6，每个等级各有不同的特权，等级越高特权更多。自2022年4月起，推出了“硬核会员”LV 6+，LV 6的会员在通过“硬核会员进阶测试”后，将成为硬核会员，有效期365天。[97]
付费功能
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2016年10月9日，B站推出付费业务“大会员”，单月购买需要人民币25元，3个月68元，12个月年费233元。大会员在bilibili享受“钛合金画质”（1080p+原生分辨率）、评论区表情、空间自主头图、抢先观看通道等服务，年费大会员还享有每月B币返利、粉红色昵称、游戏福利礼包、周边折扣等服务。[98][99]
2016年11月7日，大会员宣布改版，取消购买入口，改为会员积分兑换。[100][101]2017年9月4日，B站重新开放大会员直接购买通道。[102]
从2018年1月1日起，B站对部分番剧采取“付费先看”模式，即大会员享有优先观看最新一集的权利，其他非付费用户需要延迟一周才能观看上述番剧。番剧完结后两周，除第一集免费观看以外，其他集数大会员专享。某些番剧提供付费（B币）购买。[103]2020年1月，B站将部分番剧转为大会员专享。
目前为止，哔哩哔哩大会员可以享受的视听权限有：杜比全景声[104]、基于HDR10技术的“真彩HDR”观影模式[105]、高帧率、高码率画质（最高可达8K超高清[106]）
小黑屋功能
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2017年2月26日，B站小黑屋功能上线，旨在优化视听环境与用户体验，规范网站内容。当管理员发现违规内容后，将对违规内容进行删除并对违规者进行相应处罚，且处理结果经过审核后将张贴在小黑屋中，并由审核人员加以点评，以起到震慑作用[95][需要非第一手來源]。
2017年6月15日，B站官方推出风纪委员会功能，只要是B站LV3（同年6月16日改为LV4，后再次改为LV3，但必须入站一年以上）及以上的会员、90天内无违规操作和实名认证即可申请成为风纪委员。风纪委员可以对部分社区违规举报进行仲裁，通过投票决定该行为是否违规。[107][108]风纪委员单次任期为30天，可连任。
视频投稿和审核
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B站允许发布重复视频（称为视频撞车），但是一旦发布重复视频,后发的视频会被限制流量。同时，其允许高分辨率视频撞同内容的低分辨率视频。如果一个新番被其他UP主上传后，本来哔哩哔哩指定的UP主或负责这部新番的UP主会有两个小时的时间上传，超过两个小时后还未上传，哔哩哔哩会采用其他UP主上传的新番，2012年10月16日后投稿保护时间已被延长至六小时。在新浪视频禁止上传后，B站利用乐视云提供的视频服务上传，支持AAC编码、比特率128 Kbps的音频以及MP4编码、比特率2 Mbps，文件大小2 GB以下的视频[109]。优酷视频可投娱乐区，非娱乐区需满足一定条件[l]，且不能投音乐区、新番区。在2012年8月21日，优酷投稿一度不再被允许，但事实上优酷投稿仍会出现在该网站。8月27日，优酷来源再次被允许，不过要求更加严格，最低画质要求为高清。2011年12月1日，土豆投稿不再被允许。
2018年3月22日，bilibili清晰度升级全面公测，大幅放开各个清晰度上传视频的码率限制（其中视频比特率限制提高到6 Mbps、音频比特率限制提高到320 Kbps）。2020年5月28日，进一步开放4K分辨率画质，视频比特率限制再次提高到20 Mbps，同时支持最高达120 fps的帧率。官方宣传此次升级可以提供更加沉浸的视听体验，但只支持部分设备和浏览器。[110]。
2021年12月6日，开放8K分辨率画质，视频比特率限制再次提高到60Mbps，但只支持部分设备和浏览器。[106]
与中国大陆其他视频网站类似，bilibili同样存在内容审核，在网站合法商业化后，内容审查力度加大。2017年2月9日起不再允许个人用户上传时政类视频，仅允许认证机构上传相应内容，直到当前仍然如此。[111][需要非第一手來源]
在B站违规的视频将会进行退回或锁定处理，如视频只存在部分违规，只作退回处理，并要求用户做修改后再上传；如果视频存在整体违规，B站将会对其进行退回且锁定处理，并不允许修改。很多违规不过审的视频其解释原因只会显示“不适宜内容”很少会做出具体解释。而且B站还会出现已经过审的视频被退回的情况。2021年4月开始，地图及政治标志有关方面的审核标准及原因被写进bilibili创作公约。[112]
对于某些视频，bilibili会添加警示语：
涉及迷信、占卜的视频，BiliBili会在审核通过之后，在视频标题下方（移动端则位于上方）打出“该内容仅供娱乐，请勿轻信”字样。
涉及人工智能技术合成的视频，BiliBili会在审核通过之后，在视频标题下方（移动端则位于上方）放入“该视频疑似使用智能合成技术，请谨慎识别！”字样。
涉及酒类的视频，BiliBili会在审核通过之后，在视频标题下方（移动端则位于上方）放入“温馨提示：过量饮酒，有害健康”字样。
观看视频
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此章節需要提供更多來源，否則內容可能無法查證。
bilibili内一部分视频来源于日本各电视台的深夜动画与NICONICO动画、YouTube等视频分享网站，也有不少中国国内动漫爱好者制作的二次创作内容。视频内容是有上传者保存在或使用新浪播客、腾讯播客、优酷等中国大陆视频分享网站并通过非正规的盗链以及利用乐视云获得相应视频[113]。从2013年4月起的新番投稿列表中出现了如《我的妹妹哪有这么可爱！》等已有乐视网腾讯网等宣布取得中国大陆独家网络播出授权的动画作品，与通常惯例的字幕组作品不同，这些动画作品均由网站ID为“搬”的用户（现已改名哔哩哔哩番剧）投稿，并且视频直接来源自乐视网，腾讯网等网站。
2013年6月底，网站重新开放视频直接上传功能。直接上传的视频均被存放在乐视网旗下的乐视云中，并对上传视频进行二次编码。2013年9月初，用户发现网站的新视频播放器会根据用户IP段，对视频来源进行切换。如果IP被确定为来自中国大陆，则不论投稿视频源为新浪视频或者其他视频网站，视频源均会被重新指向乐视云，而使用VPN等网络代理技术获得中国以外的IP的用户则可如以往一样从投稿源获取视频并观看。10月起，所有乐视网版权的作品均无条件重定向至乐视源或者跳转至乐视网相关页面，且IP不属于中国大陆的都会被提示版权信息而无法播放，但是部分会员和安卓等智能手机客户端不受此影响。
另外bilibili成立了只有港澳台IP可以訪問的網站MIMI，放置從港澳台渠道獲得正版動畫授權的播放網站。後來網站關閉，授權港澳台的影片直接上傳至bilibili，但部分动画会依授權範圍而在影片標題上标注“仅限□□地區”字样，且投稿用户的ID显示为“哔哩哔哩番剧出差”。除港澳台地区外，2020年底，bilibili低调开通东南亚版专属客户端，主要放置从东南亚地区获得授权的正版动画。并提供泰文，英文，越南文，印尼文，简体及繁体中文六种不同CC字幕可选。
2020年3月23日，BV号成为B站使用的视频编号；彻底替代之前的B站AV号（纯数字编号）。BV号是由数字、大写字母和小写字母通过算法来获得的一个编码，共10位。不过目前仍然可以通过AV号找到视频并在评论区内点击AV号跳转。
B站亦拥有竖屏专属的"bilibili Story"[114]，类似于抖音和YouTube Shorts。在主打竖屏视频的姊妹产品轻视频下线之后，其与原B站竖屏模式整合为新的“Story模式”。
发弹幕
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哔哩哔哩提供以下三种常用弹幕模式：滚动弹幕、顶端弹幕、底端弹幕[115][需要非第一手來源]。给UP主（投稿视频的用户）2个硬币并获得UP主同意的用户可以发布高级弹幕。其形式包括但不限于：逆向弹幕、可精确定位于任何位置的弹幕，能够渐隐、变色、斜向的弹幕。游客和二级以下的用户不能发弹幕且游客无法在视频页面下方留言评论。普通用户可发布弹幕长度不大于100个字符，能改变颜色，选择顶端固定、底端固定、由右向左移动的弹幕，字号限制为“小”、“中”，可以发表视频页面下方留言评论，可以发布投稿，可以管理（删除/保护）自己投稿视频中的弹幕等。高级弹幕需要经过UP主同意并花费2硬币方可发送。每个视频的弹幕数量根据视频长度不同而不同：[116][117][需要非第一手來源]
视频时长
30秒以内
31秒~1分钟
1~3分钟
3~10分钟
10~15分钟
15~40分钟
40~60分钟
大于60分钟
弹幕上限
100
300
500
1000
1500
3000
6000
8000
不同的弹幕也可以由视频发布者分置在不同的“弹幕池”中，以用来保护字幕和“神弹幕”。UP主具有将所有弹幕清空或保护弹幕的权限，哔哩哔哩的弹幕播放器的“弹幕隐藏”功能的作用原理是直接停止任何实时评论的显示，这点和Acfun不同，Acfun的弹幕隐藏原理是将所有的实时评论的颜色设置为透明。
直播
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“bilibili直播[118]”是bilibili所属的弹幕式视频直播分享网站。站内直播视频主要来自主播，有时也会有游戏国际赛事、体育赛事、综艺节目甚至时政新闻的直播内容。注册用户通过实名认证申请成为主播。观众观看直播时使用金电池（与给视频上传者充电用的电池不是同一种类型）赠送的道具，主播均可获得收入；部分时政内容直播间不开通打赏和（或）评论功能。除直播外，主播也可设置在直播频道轮播之前在bilibili投稿的内容[119]。
2018年，bilibili直播全程直播LPL英雄联盟职业联赛常规赛、季后赛、季中赛、洲际赛、S8全球总决赛以及全明星等赛事[120]，观众们可以在B站官方英雄联盟赛事直播间观看60帧5000k码率的原画赛事直播。
2021年，bilibili获得英格兰足总杯中国大陆地区独家播映权，并于2021-22赛季第二轮起全程转播，这是该站首次获得播映授权的体育赛事直播[121]。
音频区
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2017年9月28日，音频区在哔哩哔哩的手机客户端上线，用户可以将客户端当作音乐播放器进行使用。[122]
2018年2月7日，加入正版音乐专辑引入计划。[123][需要非第一手來源]
投稿盈利
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2016年，bilibili推出打赏功能“充电计划”，用户的打赏将会在扣除一定成本后归up主所有。[124]
2018年1月，bilibili宣布推出“bilibili创作激励计划”，让加入计划并持续投稿的up主通过视频制作获得收入。UP主需要“电磁力（页面存档备份，存于互联网档案馆）”的“创作力”或“影响力”达到55和“信用分“不低于80分才能加入该计划。UP主加入计划后，投递的单个原创自制稿件达到1000播放量时，即可开始获得激励收益，并在次月通过贝壳系统结算。[125]
青少年模式
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2019年5月28日，bilibili宣布 bilibili APP上线“青少年模式”功能。用户每日首次打开APP时，可根据弹窗提示选择开启“青少年模式”。在“青少年模式”下，用户浏览的内容由bilibili青少年模式内容团队精选呈现。“青少年模式”下，用户每日的累计浏览时间限定为40分钟，从每日22时至次日6时无法浏览APP。用户在“青少年模式”下无法使用直播打赏功能。[126][需要非第一手來源]。但是青少年模式目前仅做了手机APP版及iPad APP版，尚未给为电脑网页版添加青少年模式。
会员购
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2017年，bilibili上线会员购功能，该功能板块属于B站基于ACG内容衍生品的电商平台，售卖动漫手办，周边和漫展票等物品。[127]