颂赞曲
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也称清唱套曲（Cantata）
教会清唱套曲（Geistliche Cantata）（BWV 1–200）
世俗清唱套曲（Weltliche Cantata）（BWV 201–216），包括咖啡清唱套曲（BWV 211）
作者不详的清唱套曲（Zweifelhafte Cantata）（BWV 217–224）
大型合唱宗教作品
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经文歌（Motet）（BWV 225–231）
b小调弥撒曲（h-Moll-Mass）（BWV 232）
四阕短弥撒（Missa Brevis）（BWV 233–236）
五首圣哉经和一首垂怜经（Sanctus, Christe eleison）（BWV 237–242）
圣母赞主曲（Magnificat）（BWV 243）
马太受难曲（Matthäuspassion）（BWV 244）
约翰受难曲（Johannespassion）（BWV 245）
路加受难曲（Lukaspassion）（BWV 246），大部分非巴赫所谱写
马可受难曲（Markuspassion）（BWV 247），文本留存但乐谱散佚，部分被重建
圣诞清唱剧（Weihnachtsoratorium）（BWV 248），为六阕康塔塔所组成
复活节清唱剧（Osteroratorium）（BWV 249）
众赞歌
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又名“四声部圣咏”（Vierstimmige Choräle）
婚礼圣咏（Choräle zu Trauungen）（BWV 250–252）
186首圣咏（BWV 253–438）
歌曲与咏叹
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出自谢梅利歌本（Schemelli-Gesangbuch）（BWV 439–507）
出自安娜的笔记本（Zweites Notenbuch für Anna Magdalena Bach）（BWV 508–518）
管风琴音乐
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三重奏鸣曲（Triosonaten）（BWV 525–530）
前奏、触技、幻想曲等等与赋格的组合作品（BWV 531–582）包含著名的Passacaglia (BWV582)
三重奏（Trios）（BWV 583–586）
杂集（BWV 587–590）
改编自其他作曲家的协奏曲（Orgelbearbeitungen）（BWV 592–597）
踏板练习曲（Pedal-Exercitium）（BWV 598）
圣咏前奏曲（Choralvorspiele）（BWV 599–771）
键盘音乐
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二声部与三声部创意曲（Zwei- und dreistimmige Invention）（BWV 772–801）
四首二重奏（BWV 802–805）
英国组曲（Englische Suite）（BWV 806–811）
法国组曲（Französische Suite）（BWV 812–817）
杂组曲（BWV 818–824）
六首组曲（six Partita）（BWV 825–830）
法式风格组曲（Ouverture im französischen Stil）（BWV 831）
组曲与多首组曲乐章（BWV 832–845）
平均律键盘曲集（Wohltemperiertes Klavier）（BWV 846–893），共两册，各24首
前奏、赋格、触技与幻想曲（BWV 894–923）
九首小前奏曲（BWV 924–932），出自给W. F. 巴赫的键盘笔记本（Klavierbüchlein für W. F. Bach）
六首小前奏曲（BWV 933–938）
五首小前奏曲（BWV 939–943）
赋格与小赋格曲（BWV 944–962）
奏鸣曲与奏鸣曲乐章（BWV 963–970）
意大利协奏曲（Italy Concerto）（BWV 971）
改编自其他作曲家的协奏曲（BWV 972–987）
哥德堡变奏曲（Goldberg-Variations）（BWV 988）
意式咏叹变奏曲（Aria variata alla maniera italiana）（BWV 989）
杂集（990–994）
鲁特琴音乐
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包括组曲、前奏曲、赋格（BWV 995–1000）
室内乐
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无伴奏小提琴奏鸣曲与组曲（Sonaten und Partiten für Violine solo, BWV 1001–1006）
无伴奏大提琴组曲（Cello-Suiten, BWV 1007–1012）
无伴奏长笛组曲（Partita für Flöte solo, BWV 1013）
为小提琴和大键琴的奏鸣曲（BWV 1014–1019）
为小提琴和其伴奏乐器的作品（Einzelne Werke für Violine und Cembalo oder Continuo, BWV 1021–1026）
为古大提琴（Viola da gamba）和大键琴的奏鸣曲（BWV 1027–1029）
为木管（Flötensonaten）和键盘乐器的奏鸣曲（BWV 1030–1035）
三重奏鸣曲（BWV 1036–1040）[a]
管弦乐
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作品号
调性
配器
作曲时间
备注
1041
A小调
Solo vn, str, b.c.
1042
E大调
Solo vn, str, b.c.
1043
D小调
2 solo vn, str, b.c.
1044
Tripelkonzert
1045
遗失的康塔塔之序曲（Sinfonia）
1046
F大调
勃兰登堡第1号
1047
F大调
勃兰登堡第2号
1048
G大调
Str, b.c.
勃兰登堡第3号
1049
G大调
Solo vn, 2 rec, str, b.c.
勃兰登堡第4号
1050
D大调
勃兰登堡第5号
1051
B♭大调
勃兰登堡第6号
1052
D小调
Cembalo, str, b.c.
1053
E大调
Cembalo, str, b.c.
1054
D大调
Cembalo, str, b.c.
1055
A大调
Cembalo, str, b.c.
1056
F小调
Cembalo, str, b.c.
1057
F大调
Cembalo, str, b.c.
1058
G小调
Cembalo, str, b.c.
1059
D小调
残篇
1060
C小调
2 Cembali, str, b.c.
学者认为改编自已散迭的作品
1061
C大调
2 Cembali, str, b.c.
1062
C小调
2 Cembali, str, b.c.
1063
D小调
3 Cembali, str, b.c.
1064
C大调
3 Cembali, str, b.c.
1065
A小调
4 Cembali, str, b.c.
1066
C大调
1067
B小调
1068
D大调
1069
D大调
1070
G小调
组曲
1071
见BWV 1046a
卡农和赋格曲
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卡农（散）（BWV 1072–1078）
音乐的奉献（Das Musikalische Opfer）（BWV 1079）
赋格的艺术（The Art of Fugue）（BWV 1080）
其他
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附加作品（BWV 1081–1126）
附加作品（21世纪增添）（BWV 1127以后）